Les Boss sont des ennemis plus résistants et plus forts que l'on trouve à la fin d'un étage du Gungeon. Battre un boss permet au joueur d'accéder à l'étage suivant.
Lorsqu'il est tué, un Boss donne au joueur un item et une arme aléatoire, quelques Crédits Hégémoniques, et de un à trois pickups tels que des cœurs, des armes ou des clés. Les Boss donneront toujours une arme si le joueur n'en a pas encore récupéré durant l'étage. Si l'un des boss des 5 premiers étages est battu sans que le joueur n'ait pris un dégât, le boss donnera un item supplémentaire : la Balle Conquête, qui donne un réceptacle de cœur supplémentaire.
Chambre du Roi Balle[ | ]
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| Roi Balle | Canardeur | Joyeux et Lunette-Noires |
Gungeon Supérieur[ | ]
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| Armaconda | Tirant-Oeil | La Gorgun |
La Mine[ | ]
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| Ballrog | Fléau retourneur | Gunzer |
Limbes[ | ]
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| Haut Prêtre | Piliers de Mort | La Muraille de Machine |
Forge[ | ]
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| Dragun |
Boss Secrets[ | ]
Mine de Poudre à canon[ | ]
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| Blockner |
Gungeon Supérieur, Mine de Poudre à canon, et Limbes[ | ]
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| Grand-Portier |
Oubliettes[ | ]
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| Blobuchef |
Abbaye de l'Arme Véritable[ | ]
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| Vieux Roi |
Le Passé[ | ]
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| Moustache noire | Monstre du Dr Griffe-de-Loup |
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| Vaisseau Absolution | Horreur interdimensionnelle |
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| Agunim | Grand-Canon | La Dernière Humaine |
Enfer des Balles[ | ]
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| Liche |
Notes[ | ]
- Quand le joueur entre dans le passé de son personnage, il perdra tous ses objets et armes mais il gardera les ballablancs et les points d'armure.
- Certains objets sont quand même toujours transférés dans le passé, dont la Légion d'honneur galactique et la Photo furieuse.
- Les boss ont un plafond de dégat qui varie selon l'étage:
- Forteresse du Seigneur du Plomb: 25
- Gungeon Supérieur: 35
- Mine de Poudre à canon: 50
- Limbes: 58
- Forge: 65
- Enfer des Balles: 70
- Le plafond de dégat est ignoré par le Canon artisanal et le Lance-roquettes Yari.
- Dans le mode Spécial Boss, les boss n'ont pas de plafond de dégat.
- Le plafond de dégat est ignoré si l'arme effectue plus de 1000 dégats.